Нотатки з лекції про синтез нуклеозидів, нуклеозид фосфатів та олігонуклеотидів

Вступ

• Тема лекції: Синтез нуклеозидів, нуклеозид фосфатів та олігонуклеотидів.
• Нуклеозиди: продукти конденсації нуклеїнових основ із вуглеводами (рибоза, дезоксирибоза).
• Олігонуклеотиди: полімери нуклеозид-фосфатів, короткі нуклеїнові кислоти.

Синтез нуклеозидів

• Метод синтезу:
  • Найпоширеніші методи: реакція Селіл Гільберта, реакція Форбругіна.
  • Використовуються сирильовані гетероциклічні основи та електрофільні рибози.
  • Необхідність кислоти Льюіса в системі (тетрахлорид олова в дихлоретані).
• Механізм конденсації:
  • Високий вихід при кімнатній температурі.
  • Використання водного аміаку для отримання нуклеозиду.

Недоліки реакції

• Можливість утворення ізомерних продуктів через кількість нуклеофільних атомів нітрогену.
• Потреба у захисті атомів нітрогену для уникнення побічних продуктів.

Синтез дезоксирибонуклеозидів

• Установлення селінного захисту на положення 3 та 5 рибози.
• Радикальне відновлення з трибутилстананом.
• Складнощі в утворенні альфа- та бета-ізомерів.

Аномальні нуклеотиди

• Висока біологічна активність аномальних нуклеозидів.
• Приклади: препарати протипухлинної дії, противірусні препарати.

Синтез нуклеозид монофосфатів

• Популярні методи:
  • Твердофазний синтез нуклеотидів.
  • Застосування фосфідів, фосфорамідитів.
• Високий вихід без потреби в очищенні.

Синтез нуклеозид ди- та трифосфатів

• Використання похідних пірофосфорної кислоти.
• Активування 5-штрих положення для нуклеофільної атаки.
• Використання методів твердофазного синтезу для отримання трифосфатів.

Синтез олігонуклеотидів

• Популярність через ефективність порівняно з пептидами.
• Твердофазний синтез дозволяє досягати довжини до 200 залишків.
• Особливості: застосування флуоресцентних молекулярних біконів.

Завершення лекції

• Лекція була коротшою, ніж зазвичай.
• Дякую за увагу!