Chapitre 2 : Données censurées

Tests Statistiques et Modèles Multivariés

Introduction

• Continuation du chapitre précédent sur les données censurées.
• Focus sur les tests statistiques et les modèles multivariés.

Comparaison des taux de rechute entre hommes et femmes

• Test statistique de la différence des taux de rechute entre hommes et femmes.
• Utilisation de la méthode du Log-Rank (test de rang, similaire au test de Wilcoxon).
• Conditions de validité :
  • Nombreux temps de décès.
  • Observation tous les six mois avec beaucoup de décès par intervalle.
• Application sur les données avec R : survdiff() suivi de Surv().
• Interprétation : p = 0.87, pas de différence significative entre hommes et femmes.
• Limite : Petit échantillon de femmes (N=18, Observed=3).

Association entre survie et variable quantitative

• Exemple : Tester l'association entre risque de rechute et âge.
• Association possible dans deux sens (jeunes vs âgés).
• Méthode statistique : Modèle de Cox.
• Application avec R : coxph() suivi de Surv().
• Interprétation des résultats :
  • p = 0.047 (juste significatif à 5%).
  • Coefficient négatif : Âge semble protéger contre la rechute.

Modèle de Cox avec plusieurs variables explicatives

• Tester l'association entre risque de rechute et plusieurs variables (âge, sexe, événements négatifs).
• Application avec R : coxph() de Surv() suivi des variables explicatives.
• Interprétation des résultats : Seul âge statistiquement associé (limite) au risque de rechute.
  • Sexe et événements négatifs : faible puissance statistique.

Interprétation des Coefficients et Hazard Ratio

• Coefficients négatifs interprétés comme protecteurs.
• Exponentielle des coefficients : Hazard Ratio.
  • Exemple : Événements de vie négatifs (HR = 0.64) => 36% moins de chances de rechute.
  • Interprétation prudente due à faible échantillon.

Vérification des conditions de validité du modèle de Cox

• Condition essentielle : Hypothèse des risques instantanés proportionnels.
• Vérification graphique avec R : plot() de cox.zph().
  • Courbes doivent être horizontales.
• Inclusion de variables catégoriques et termes d'interaction possibles.

Résumé

• Importance de refaire les exercices sur ordinateur pour bien comprendre les notions délicates.