Appunti sulla Regolazione dell'Espressione Genica negli Eucarioti

Introduzione

• Studio della regolazione dell'espressione genica negli eucarioti.
• Focus su attivatori e repressori che si legano a siti specifici del DNA.
• Discussione dei livelli di organizzazione del DNA: nucleosomi, cromatina, cromosomi.

Attivazione della Trascrizione

• Per attivare la trascrizione, è necessario un legame produttivo tra RNA polimerasi e promotore.
• Cinque tipi di proteine coinvolte:
  1. Attivatori della trascrizione
  2. Regolatori architettonici
  3. Proteine che rimodellano la cromatina
  4. Coattivatori
  5. Fattori di trascrizione di base

Attivatori della Trascrizione

• Si legano a siti specifici del DNA per facilitare la trascrizione.
• Possono essere specifici per singoli geni o influenzare più promotori.
• Sensibili a segnali ambientali.
• Siti specifici di legame:
  • UAS (Upstream Activator Sequence) nei lieviti.
  • Enhancer negli eucarioti superiori.

Regolatori Architettonici

• Proteine non istoniche, presenti nella cromatina.
• Creano anse nel DNA per favorire interazioni tra complessi proteici.
• Esempio: Proteine HMG (High Mobility Group).

Proteine che Rimodellano la Cromatina

• Enzimi che modificano i nucleosomi.
• Importanti per le differenze tra eterochromatina ed eucromatina.
• Quattro famiglie:
  1. SWI-SNF: attiva la trascrizione.
  2. IE-SNF: attiva la trascrizione.
  3. PSWI: reprime la trascrizione.
  4. CHD: può attivare o reprimere la trascrizione.
  5. INO80: attiva la trascrizione o ripara il DNA.

Coattivatori

• Complessi proteici che assistono gli attivatori.
• Esempio principale: Mediatore (complesso essenziale per la trascrizione con RNA polimerasi 2).

Fattori di Trascrizione di Base

• TBP (Tata Binding Protein): si lega al Tata Box.
• TF2: fattori di trascrizione per RNA polimerasi 2.
• Distinzione: promotori senza sequenza Tata utilizzano il complesso TF2D.

Processi di Attivazione della Trascrizione

• Gli attivatori si legano per primi al DNA.
• Legame con gli enhancer stimola la trascrizione.
• Coinvolgimento delle proteine che rimodellano la cromatina e del coattivatore.
• Formazione del complesso di pre-inizio (PIC) per l'attivazione della trascrizione da parte di RNA polimerasi 2.

Conclusioni

• Comprensione dei meccanismi di attivazione della trascrizione.
• Importanza della connessione tra attivatori, coattivatori, e RNA polimerasi.
• Invito a continuare a studiare e aggiornarsi.

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