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Structure et Génétique Bactérienne

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BACTERIOLOGIE

2m e Anne de Pharmacie

S3

Pr. Souly K

2020 - 2021

UNIVERSITE MOHAMMED V DE RABAT

FACULTE DE MEDECINE ET DE

PHARMACIE Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

1

LA STRUCTURE BACTERIENNE I- Introduction

Intrt de la connaissance de la structure bactrienne:

Dterminer la Taxonomie dune bactrie

Meilleure comprhension des maladies infectieuses

Connaitre le mcanisme de virulence des bactries

Connaitre le m ode daction des antibiotiques et dantibiorsistance

Nomenclature:

Ordre, famille, genre et espce sont exprimes par * Un nom latin (italique) premire lettre en majuscule * Une terminaison : - ales pour lordre

  • ae pour la famille - us, er ou a pour le genre et espce
  1. Historique:

Dcouverte du monde bactrien au dbut du 18me sicle par Antonie Van Leeuwenhoek (1632-1723) suite la dcouverte du microscope optique

tude des bactries en 2me partie du 19me sicle par Louis Pasteur (1822-1895)

  1. Dfinitions dune bactrie

Microorganisme structure unicellulaire procaryotique

Paroi rigide form de peptidoglycane

sans noyau diffrenci,

de petite taille (0,5 2 m de l et de 2 10 m de L),

de structure relativement simple,

doue dun pouvoir de multiplication autonome,

Croissance exponentiel Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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Etude comparative entre Eucaryotes et Procaryotes :II- STRUCTURE ET ANATOMIE BACTERIENNE Morphologie:

La taille : Variable de 0,1 600 m

La forme: les formes arrondies: coques

les formes allonges: bacilles

les formes incurves: vibrions les formes spirales: spir ochtes, spirilles

Le mode de groupement:

Les coques : en amas (staphylocoques), en chanettes (streptocoques), en grains de caf (gonocoques).

Les bacilles: droits (Escherichia Coli , salmonelle..), incurvs (vibrion), palissades (Corrynbactries). Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

3LA STRUCTURE BACTERIENNE

  1. Structure obligatoire A- Paroi

Enveloppe rigide qui assure la FORME (exosquelette) et la PROTECTION

Prsente chez toutes les espces bactriennes l'exception des mycoplasmes.

Enveloppe rigide entourant la bactrie et conditionne sa forme

Selon sa composition et sa structure dfinit 2 groupes de bactries: les Gram positif et les Gram ngatif

Comporte un polymre commun, partie la plus interne : PEPTIDOGLYCANE LA STRUCTURE BACTERIENNE

Gram ngatif Gram positif

La structure de la paroi des Mycobactries est particulire. Cette paroi comprend : - du peptidoglycane

  • des lipopolysaccharides constitus principalement de mycolate d'arabino-galactane et d'acide mycolique LA STRUCTURE BACTERIENNE

Paroi des mycobactries

Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

4La paroi est constitu principalement par: 1. Peptidoglycane +++ 2. Acide teichoique 3. Membrane externe 4. Espace periplasmique

1 .Peptidoglycane:

  • Polyoside dunits rptitives de

relies entre elles par des Chainons ttrapeptidiques:

(ex : L-Ala D-gly L-Lys D-Ala) LA STRUCTURE BACTERIENNE

Synthtis principalement par des enzymes ou PBPs (Penicillin-Binding-Proteins) ou PLP =protines se liant la pnicilline ou PLP

  • Transglycolase * Transpeptidase * Carboxypeptidase

2 . Acides teichoques

Polymres de molcules de glycrol jointes par des groupes phosphates. Ils sont chargs ngativement

Permet au peptidoglycane de s'attacher la membrane des bactries.

Prsent sur les Gram+ mais pas sur les Gram- .

3- Membrane externe

Couche trilamellaire - Phospholipides (double couche) - Lipopolysaccharide (LPS), endotoxine ( Couche externe) - Protines : - de structure consolidant la paroi - porines : permabilit Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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  1. Espace priplasmique:

Il contient divers enzymes pouvant dgrader des antibiotiques appartenant la famille des bta-lactamines

B- Membrane cytoplasmique

Aspect trilamellaire - Protines - Phospholipides (double couche)

Absence de cholestrol

Rle :

Mtabolisme nergtique (contient de nombreux enzymes),

Barrire osmotique,

Contient un systme de transport, les permases : pntration slective de certaines

substances (sucres, aa)

Prolongement de la membrane cytoplasmique = msosome qui a un rle dans la division cellulaire,

Sporulation.

Fonction respiratoire

Lieu de fixation des flagelles et dinitiation de leur mouvement

C- Cytoplasme

hydrogel collodal

Compartiment cellulaire limit par la membrane plasmique

ADN chromosomique et plasmidique

ARN ribosomal

Granulations et substances de rserve

Vacuoles de gaz

PH entre 7 et 7,2

D- Ribosomes

Nombreux : ~ 15 000 / bactrie

Constitution :

2 sous units (50S et 30S)

Chaque unit est forme d'un mlange - d'ARN (= ARNr) (23S et 16S) (~ 60% ) Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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  • De protines (40%).

  • Rle dans la synthse protique :

  • Lieu de traduction du message gntique en protines.

  • Cible dantibiotiques qui agissent en perturbant la synthse protique: Aminosides,

Cyclines, Phnicols, Macrolides, Acide fusidique

E- Chromosome

Dans le cytoplasme, dans une rgion appele nuclode. - Pas de membrane nuclaire

  • Filament unique dADN

. Circulaire +++ . bicatnaire

. Surenroul dun millimtre de longueur

  • Sauf exception quelques bactries ont 2 chromosomes (Brucella melitensis), ou 3 chr (Bulkholderia cepacia)

  • Rares bactries ont un chromosome linaire Ex : Borrelia burgdorferi - Protines fixes dessus:

ARN polymrase: Transcription

ADN polymrase: Rplication, rparation et de recombinaison de l'ADN.

Topo-isomrases: Modifiant le degr denroulement = la topologie

= Surenroulement positif de lADN

ADN gyrase : Responsable du surenroulement ngatif de lADN

2- Structure facultatives A- Polysaccharides de surface A1- Capsule

Elment le plus superficiel bien structur

Polysaccharidique (polymre de 1-2 sucres)

La capsule est antignique, les antignes capsulaires sont dnomms antigne K

Intrt mdical:

Rle dans la virulence: la rsistance la phagocytose (pneumocoque)

Diagnostic : antignes solubles dans les liquides biologiques

pidmiologie : typage srologique (pneumocoque, hmophile)

Vaccins : base de polymres capsulaires purifis (pneumocoque)

A2- Glycocalyx

Feutrage de fibres polysaccharidiques = structure rticule lche

Difficile mettre en vidence

Si quantit importante en parle de SLIME

Intrt mdical:

Proprits dadhsion (biofilm), responsable de lattachement :

des bactries entre elles

entre bactries et surfaces solides (biomatriaux, cathters..) Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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entre bactries et surfaces cellulaires (buccales, respiratoires)

entre bactries et supports inertes : laboration de la plaque dentaire (ex : Streptococcus mutans

Proprits de rsistance aux agents anti-infectieux (biofilm)

B- Pili B1- Pili communs (Fimbriae)

Structure fibrillaire protique (adhsine),

2 3 m de longs rigides, nombreux et rgulirement disposs la surface

Prsent chez les bactries Gram

B2- Pili sexuels

peu nombreux (1 4)

longs - creux - extrmit distale renfle

cods par des gnes plasmidiques (facteur de fertilit F)

la conjugaison bactrienne : rapprochement des 2 bactries avec contact cellulaire troit C- Flagelles

Assure la mobilit des bactries

Nature protique Flagellines et sont antigniques Ag H

un seul flagelle polaire = ciliature monotriche

une touffe de flagelles polaires = ciliature lophotriche,

un flagelle chaque ple = ciliature amphitriche

des flagelles entourant la bactrie = ciliature pritriche

D- Spore

Forme de rsistance en milieu extrieur si les conditions sont dfavorables et si les conditions redeviennent favorables on pourrait avoir une vgtation de la spore pour donner nouveau une bactrie

Structure : Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

1

Gntique bactrienne

I- Dfinitions 1. Gnome bactrien

Ensemble de gnes prsents sur:

ADN chromosomique

LADN extra-chromosomique: Plasmide, Transposant, Intgron

Modification possible pour adaptation dans lenvironnement

  1. Chromosome bactrien

1 chromosome (sauf exception) anucl

Habituellement circulaire bicatnaire et enroul

Taille variable de 600 8000 Kb

Polymre de nuclotides : Sucre (dsoxyribose ou ribose) + Acide phosphorique + Une base purique ou pyrimidique ( A, G, C, U, T)

2 chaines runies par des ponts dH ydrognes entre les paires de bases ( A-T) et (C-G) 3. Plasmides

lment gntique facultatif mobile

ADN extra-chromosomique circulaire bicatnaire

Rplication autonome

Taille variable de 10 200 Kb Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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  1. Transposant

Fragments dADN bicatnaires mobiles qui peuvent sinsrer dans le

gnome chromosomique ou plasmidique en de nombreux endroits diffrents (gnes sauteurs)

  1. Intgron

lment gntique facultatif caractris par la prsence dun gne dintgrase, dun site de recombinaison et dun promoteur, et galement

par leur capacit intgr un ou plusieurs gnes sous forme de cassettes et les exprimer ADN donneur ADN donneur

Tn

ADN receveur ADN receveur

transposition transposition

ADN donneur ADN donneur

Tn

ADN receveur ADN receveur

transposition transposition

Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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  1. Gnotype/ Phnotype: 1. Gnotype:

Ensembles des informations codes par le gnome Gnome 8 Transcription Traduction ARNm Protines

  1. Phnotype:

Expression du gnotype Dpend souvent des conditions ext. Ex: Gnotype galactosidase + Lactose Synthse de lenzyme Phnotype galactosidase + 9 Lactose

X

Pas de synthse de lenzyme Phnotype galactosidase -

II- Variations gnotypiques: 1. Mutations chromosomiques A. Dfinition :

Modification gnotypique qui va aboutir un nv phnotype

Caractre rare, spontane ou induite, discontinue, spcifique et stable.

Tout changement dans la squence nuclotidique dun gne suite : Dltion, Insertion ou Substitution de nuclotides

Mutation sur un seul nuclotide (mutation ponctuelle) Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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B. Caractres des mutations :

Au nombre de 4:

B1.Raret : Phnomne rare naffectant quun petit nombre de bactries

dans une population . sexprime par le taux de mutation

B2. Spontanit : Des mutations peuvent tre induites aisment par des agents physiques (UV et RX) ou chimiques

B3. Stabilit : B4. Spcificit indpendante : La mutation naffecte quun seul caractre

sans modifier les autres.. Notion de mutation simultane: Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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  1. Acquisition dADN exogne

Transfert d1 rplicon (unit gntique capable dautorplication) dune

cellule donneuse une autre receveuse

3 processus: A. Transformation

B. Conjugaison ++++

C. Transduction

A. Transformation Conditions:

  1. Cellule receveuse comptente (paroi permet le passage trans-

parital dADN: naturellement/ artificiellement) 27

Fragment dADN issus d 1cellule donneuse Cellule receveuse

  1. La cellule receveuse absorbe lADN (seuls de la mme espce) de la cellule donneuse
  2. Recombinaison entre ADN cellule donneuse et ADN cellule receveuse (Etape exige une troite homologie des squences nuclotidiques endogne est exogne Cellule transforme sur le plan gntique ADN non intgr (en cours de dgradation) Libration dADN nu dans lenvironnement Fixation de lADN double brin Translocation dADN simple brin dans le cytoplasme

B. Conjugaison

les organismes ont mis au point un systme leur permettant de

s'changer du matriel gntique , en particulier des plasmides

Processus : 2 cellules de sexe diffrent entrent en contact et s'changent toute une partie de leur matriel gntique

Transfert dADN plasmidique +++ Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

6 La qualit du donneur dans la conjugaison est confr

par 1 plasmide appel facteur de fertilit (F)

Code pr la synthse des pili sexuels qui jouent un rle

ds laccolement des 2 bactries qui vont conjuguer

Bactrie F+

Bactrie mle

Bactrie F-

Bactrie femelle

29 30

Quand le facteur F est transfr

dune cellule donneuse F + une

cellule receveuse F - cette

dernire est convertie en

cellule F +

C. Transduction

ADN est transfr d'une espce une autre via des virus ou des phages

Figure 1 : Schma de la structure dun bactriophage Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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  1. Remaniement intra-gnomique

. Modification de lorganisation du gnome (/ ex: ordre des

gnes) . Dplacement de transposons dun site gnomique un autre Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

1

POUVOIR PATHOGNE DES BACTRIES

I- Introduction

Le Pouvoir pathogne: ensemble des proprits biologiques d'un micro-organisme qui lui permettent de provoquer la maladie chez un hte dtermin

Virulence : Terme quantitatif qui indique le degr de pathognicit dun micro-organisme

Bactries pathognes strictes: responsable dune maladie mme chez le sujet sain immunocomptent.

Bactries opportunistes: bactries commensales ne donnant pas de maladie chez le sujet sain immunocomptent mais peuvent devenir pathogne suite : a) un dsquilibre de la flore normale du territoire o ils rsident b) un affaiblissement des dfenses de l'hte c) leur migration dans un autre territoire de l'hte Il existe 4 mcanismes gnraux pour lesquels les bactries peuvent provoquer une maladie chez lhomme ou lanimal : 1- Ladhsion suivie de colonisation 2- Linvasion des tissus 3- Production de toxines 4- Dclanchement dune rponse immunitaire dltre Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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II- Mcanisme gnraux de la pathognicit bactrienne

1- Facteurs dadhsion et de colonisation A- Les adhsines protiques Pili ou fimbriae :

Adhsines non fimbriales : protines de surface de la paroi bactrienne,

E. coli : protine Pap ------ crbroside des cellules vsicales

Ladhsion permet aux bactries:

dune part de rsister un flux,

dautre part dassurer un contact troit avec les nutriments prsents la surface cellulaire

B- Les adhsines polysaccharidiques B-1- Glycocalix

Ex : Streptococcus mutans => formation de la plaque dentaire ;

B-2- Lacide lipotichoique : chez les Gram positif (Streptocoque) Adhsine permettant la bactrie de se fixer sur la fibronectine qui recouvre les cellules pithliales

2- Facteurs dinvasion des tissus

Cest la multiplication de la bactrie lintrieur des tissus de lhte entrainant une raction inflammatoire accompagn dun processus pyogne (abcs). Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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2-1- Invasines de surface

A- Capsule polysaccharidique (Les souches qui ont perdu leur capsule sont dpourvues de virulence : ex Pneumocoque et bacilles de charbon) B- Protine de la paroi La protine M des streptocoques pyognes limite le dpt du complment C3b sur la surface de la bactrie ce qui rduit lopsonisation et donc empche la phagocytose

2-2- Invasines Enzymes inactivatrices de la rponse immunitaire ou inflammatoire

A- Endopeptidase Ex : Neisseria, Heamophilus, Streptocoque B- Peptidase

2-3- Invasines Enzymes facilitant la pntration tissulaire

les hyaluronidases:

les fibrinolysines:

les collagnases : Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

4

les hmolysines:

Action hmolytique qui augmente lapprovisionnement en fer que la bactrie a besoin

les leucocidines: Staphylococcus aureus

Les leucocidines de Panton Valentine

ont pour cible la destruction des polynuclaires, les monocytes et les macrophages

les coagulases staphylococcus aureus : caillot protecteur autour de la bactrie

2-4- Systme dapprovisionnement en nutriments (fer)

Production de sidrophore

Rcepteurs de lactoferrine ou transferrine

  • Helicobacter pylori, Neisseria meningitidis et gonorrhea sont capable de synthtiser des rcepteurs pour la transferrine

2-5- Persistance en intracellulaire (Macrophages)

Certaines bactries sont capables de rsister aux lysosomes macrophagiques, et sont responsable dinfection chronique ou rechute suite une ractivation Ex : bacilles tuberculeux, listriose Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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3- Production de toxines

3-1 Exotoxines :

Protines produites par la bactrie et scrtes lextrieur de celle ci

Peuvent tre transformes en anatoxine par action du formol pour la prparation des vaccins anti-toxines.

3-1-1- Toxine bloquant la synthse protique

3-1-2- Neurotoxines

Clostridium agent du ttanos :

Clostridium agent du botulisme :

3-1-3- Enterotoxines A- Toxines cytotoniques

Laisse intact la cellule hte

Provoque un dsquilibre hydro-electrolytique Ex : Toxine de cholera, E. Coli entrotoxinogne (mme mcanisme) Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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b- Entrotoxine cytotoxique

Caractre invasive des cellules hte

E. Coli enteropathogne (EPCE) E. Coli enterohmatogne (EHCE) Clostridium difficile

3-2 Endotoxines :

composant du corps bactrien, libres lors de la lyse

Existe uniquement chez les bactries Gram ngatif

Constitus par les lipopolysaccharides de paroi

Ne peuvent pas transforme en anatoxine

Elle est relche en grande quantit lors de la lyse cellulaire Tableau I : COMPARAISON DES PROPRIETES DES ENDO ET EXOTOXINES

4- Dclanchement dune rponse dltre

Rhumatisme articulaire aigue (RAA) ou Glomrulonphrite aigue (GNA) aprs une infection post-streptococcique Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

1

LES ANTIBIOTIQUES Classification et M ode daction

I. INTRODUCTION

  1. Dfinition

Lorigine du mot antibiotique vient du grec anti : contre , et bios : la vie .

Cest une substance chimique le plus souvent dorigine naturelle produite par des microorganismes, semi-synthtique ou purement synthtique par synthse chimique (Quinolones).

Elle Perturbe le fonctionnement de cibles bactriennes spcifiques,

Inhibe la croissance (Antibiotique BACTERIOSTATIQUE)

Dtruire les microorganismes (Antibiotique BACTERICIDE)

  1. Proprit dun antibiotique

2.1. Mesure de la CMI dATB sur une bactrie Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

2

2.2. Mesure de la CMB dATB sur une bactrie

  1. Historique Fleming (1928) Pnicilline Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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Antibiotiques Naturels

1929 Pnicilline G Pnicillium notatum

1944 Streptomycine Streptomyces griseus

1945 Cphalosporine C Cephalosporium acremonium

1952 Erythromycine Streptomyces erythreus

1955 Pristinamycine Streptomyces pristinaespiralis

1954 Kanamycine Streptomyces kanamyceticus

1956 Vancomycine Nocardia orientalis

Antibiotiques hmisynthtiques

II. CLASSIFICATION DES ANTIBIOTIQUES

La classification se fait selon :

Origine

Composition chimique

Spectre dactivit

Cible dattaque (Mode daction )Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

4

Principales familles dantibiotiques

Btalactamines

Famille Noyau Antibiotique /DCI Spectre

Btalactamines

Pname

Pnicilline G

Pnicilline V

Etroit

Pnicilline M

mticilline

oxacilline

flucloxacilline

Etroit

Aminopnicilline :

ampicilline

amoxicilline

Carboxypnicilline :

ticarcilline

Ureidopnicilline :

pipracilline

Amidinopnicilline

pivmcillinam

mcillinam

Large

sulbactam

tazobactam

nhibiteur de -lactamase

Cphme

1re gnration

cfazoline

cfalotine

Large

Cphme

2e gnration

cfuroxime

Cfoxitine b

Cfaclor

Large

Cphme

3e gnration

cfixime

cftriaxone

cftazidime

Large

Cphme

4e gnration

cf pime Large

Carbapnme imipnme

ertapnme

Large Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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Clavame acide clavulanique Nul (inhibiteur de -

lactamase)

Monobactame

(aztidine)

azthronam Etroit (antipyocyanique)

et autres BGN

Famille Antibiotique /DCI Spectre

Aminosides

gentamicine

amikacine

tobramycine

kanamycine

streptomycine

Large Inactifs sur les

anaorobies

Peu actif sur

streptocoque

Aminocyclitols spectinomycine Large

Ttracyclines ttracycline

doxycycline

Large

Polypeptides

Polymyxines Etroit

bacitracine Etroit

Glycopeptides vancomycine

ticoplanine

Etroit

Phnicols chloramphnicol

thiamphnicol

Large

Macrolide et apparent es

Macrolides vrai

erythromycine

azithromycine

josamycine

spiramycine

Etroit

Lincosamides

lincomycine

clindamycine

Streptogramines

1/ Streptogramine A : p ristinamycine IIA,

dalfopristine, virginiamycine M

2/ Streptogramine B : p ristinamyci ne IA,

quinupristine, virginiamy cine S

3/Streptogramine A + B :

pristinamycine, quinupristine -

dalfopristine, virginiamycine

Rifamycines

et s es Drivs

rifamycine SV Etroit

rifampicine Large (antituberculeux )Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

6

Sulfamides sulfamthoxazole Large

Diaminopyrimidines trimthoprime Large

Quinolones et Fluoroquinolones

Quinolones

acide nalidixique

Etroit

Fluoroquinolones

ofloxacine

ciprofloxacine

Large

Nitrofuranes nitrofurantone Large

Nitro -imidazoles mtronidazole Etroit (bactries

anarobies)

Autres

antibiotiques

fosfomycine Large

acide fusidique Etroit

LES

ANTITUBERCULEUX

Isoniazide

Rifampicine

Ethambutol

Pyrazinamide

Streptomycine

ethionamide

Large Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

7

IV-MODES DACTION DES ATB 26

1- ATB AGISSANT SUR LA PAROI BACTERIENNE

Bta-lactamines.

Glycopeptides.

Fosfomycine .

1-1- Rappel sur la Biosynthse du Peptidoglycane Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

8

A- LES BETA LACTAMINES Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

9

B- Les glycopeptides

Agissent au stade parital de synthse du peptidoglycane

Vient recouvrir D-Ala-D-Ala terminal,

C- FOSFOMYCINE Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

10

Agit au dbut de la synthse du peptidoglycane

fosfomycine se comporte comme un analogue du phosphonolpyruvate et inhibe l'enzyme pyruvyl-transfrase :

UDP-N-actylglucosamine + Phosphonolpyruvate ----> Phosphate + Acide UDP-N-actyl-muramique

2- Antibiotiques inhibiteurs de la synthse protique 2-1- Inhibiteurs de la sous-unit 30S

2-1-1- AMINOSIDES

1-fixation sur lARN ribosomal (30S)

2-Changement morphologiques du ribosome

3-Altration de toutes les tapes de la synthse protique

4-Synthse de protines anormales.

2-1-2- TETRACYCLINES

Se lient de faon rversible la sous-unit 30S des ribosomes et empchent l'attachement des amino-acyl-tRNA au ribosome.

2-2- Inhibiteurs de la sous-unit 50 S

Les phnicols

Les macrolides et Apparentes

Bloque llongation protique en inhibant la formation des liaisons peptidiques (inhibe la peptidyltransfrase qui permet llongation de

la chaine peptidique). Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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3- Antibiotiques Inhibant de la synthse des acides nucliques 3-1- Quinolones/Fluoroquinolones

3-2-Rifamycines

Inhibition de la transcription de lADN par fixation sur lARN polymrase

ADN-dpendante.

3-3-Sulfamides Trimthoprime Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY 12 3-4-Nitro-imidazols

Coupure des brins dADN

4- Antibiotiques agissant sur la membrane cytoplasmique Polymyxines B et A (Colistine)

Altrent la permabilit membranaire par un mcanisme comparable celui des dtergents cationiques (formation de pores de la membrane cytoplasmique).

Distribution altre des acides gras des phospholipides membranaires

Mort cellulaire. Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

1

MECANISMES DE RESISTANCE AUX ANITIBIOTIQUES

I- CRITERES DUN ANTIBIOTIQUE

Possder une cible bactrienne spcifique.

Accs la cible

Reste sous forme active

Interaction avec la cible en Inactivant cette cible

II- SUPPORT GENETIQUE DE LA RESISTANCE BACTERIENNE

1- LA RESISTANCE NATURELLE

Caractre prsent chez toutes les souches bactriennes de lespce ou du genre bactrien.

Permet de dfinir le spectre antibactrien dun antibiotique

Utilise comme caractre servant au diagnostic de lespce.

Support gntique est le chromosome bactrien

Espce bactrienne Rsistance naturelle (exemple)

Proteus spp Ttracycline, Colymicine, Nitofuranes

Enterococcus feacalis Pnicilline M, Lincosamides, Sulfamides

Haemophilus spp Pncilline M, Lincosamides

Klebsiella spp Amino- urido-carboxypnicilline

Enterobacter spp, Citrobacter spp, Aminopnicilline , Aminopnicilline + acide clavulanique , C1G et C2G

Morganella sp , Providencia sp Aminopnicilline , Aminopnicilline + acide clavulanique , C1G et C2G, Colistine, Cycline, Nitofuranes

2- LA RESISTANCE ACQUISE

Apparat avec lemploi des antibiotiques chez un certain nombre despces bactriennes

naturellement sensibles

Lacquisition de cette rsistance peut tre lie un lment gntique extra chromosomique

(plasmidique++) (exogne) ou une mutation chromosomique (gne prexistant). Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

2

b. Rsistance extra-chromosomique

Le support est:

un plasmide

un intgrons

un transposon

acquis par conjugaison ou plus rarement par transduction. Mcanisme de la rsistance bactrienne aux antibiotiques

Schma reprsentatif de la transmission de la rsistance plasmidique.

III- SUPPORT BIOCHIMIQUE DE LA RESISTANCE BACTERIENNE

1- Modification de la cible

1-1- Cible paritale

a. Modification des PLP:

Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

3

b. Modification du prcurseur du peptidoglycane :

1-2-Cible Intracellulaire

a. Modification de la cible ribosomale

b. Modification des topoisomrases:

Gne de L'ADN gyrase: des mutations chromosomiques ou acquisition rcemment de gne plasmidique de la gyrase peuvent co nduire la production dADN gyrase modifies insensibles aux quinolones et Fluoroquinolones.

2- Diminution de la permabilit membranaire 2-1- Rsistance lie la structure externe de la bactrie a- Capsule et Slime

b- Charge lectrique de la Paroi

2-2- Rsistance lie la structure de la membrane externe a- Le positionnement des LPS de la membrane externe

Le positionnement des LPS de la membrane externe des BGN (Entrobactries) est fortement dissymtrique ce qui rend ces bactries impermable aux ATB lipophiles

b- Les porines:

Toute modification (quantitative ou qualitative) de ces porines entrave la pntration des antibiotiques Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

4

3- Excrtion de lantibiotique (Systme defflux)

4- Inactivation enzymatique. 4-1- les btalactamases

A- Les PENICILLINASE :

A-1- Pnicillinase chromosomique

Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

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A-2- Pnicillinase plasmidique +++

Pnicillinase du staphylococcus aureus

Extracellulaire

Sensible aux IBL

Pnicillinase Des BGN

Plus de 30 varits denzymes, plus communs sont TEM -1 et SHV-1

Sensibi lit variable aux autres btalactamine selon le niveau dexpression :1- Bas niveau : 2- Rsistante aux inhibiteurs : 3- Haut niveau : 4- A spectre tendu BLSE :

Phnotype BLSE : Synergie entre les C3G en direction de laugmentin sous forme dun bouchon de

champagne B- Les Cphalosporinases :

Dcrites chez diffrentes espces de BGN

Insensible lacide clavulanique

Selon le niveau dexpression on distingue :Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

6B-1- Cphalosporinase Bas niveau : B-2- - Cphalosporinase Hyper produite : B-3- - Cphalosporinase Large spectre :

C- Les carbapnmases : C-1- Mtallo--lactamases ( MLs)++

Ncessitent lion zinc pour leur activit

C-2- Non mtallo--lactamases ( MLs)

sont des enzymes dites srine active

4-2- les enzymes inactivant les aminosides Cours / Deuxime Anne Pr K. SOULY

7

4-3- les enzymes inactivant les Phnicols

Une rsistance plasmidique due la production d'une "chloramphnicol actyltransfrase" (Actylation des deux radicaux OH)

Isoles chez les entrobactries, Staphylococcus sp, Streptococcus sp, Neisseria sp, Haemophilus sp, Pseudomonas sp.

d - les enzymes inactivant les macrolides et apparents :

Macrolides-Lincosamides-Streptogramines (MLS):

Production destrases ou de phosphotransfrases lorigine de la rsistance haut niveau

des Entrobactries aux Macrolides

Certains staphylocoques sont rsistants aux streptogramines A + B par production: Actyltransfrase qui hydrolyse StreptogramineA Hydrolase qui inactive Streptogramine B

Rsistance aux lincosamides par production dune nuclotidyltransfrase.