La recombinación de los cromosomas homólogos que llevan alguna inversión es muy interesante porque produce unos resultados con distintos tipos de pérdidas, de lesiones, ganancias, etc. Por ejemplo, se representa aquí una inversión paracéntrica. La inversión se ve porque estos segmentos de distintos colores, se ve que coinciden aquí el azul y el gris, pero en cambio el naranja y el amarillo están en el mismo color. invertidos. Esta es la región que tiene la inversión, que como vemos no incluye el centrómero, por eso es una inversión paracéntrica.
Cuando estos dos cromosomas se tienen que alinear durante la meiosis, evidentemente no pueden por efecto de la inversión, y el cromosoma que lleva la inversión adopta una estructura en bucle, de manera que ahora sí ambos cromosomas pueden alinearse correctamente en todas sus regiones. Cuando aquí tiene lugar una recombinación dentro del bucle, el resultado va a ser que uno de los cromosomas será dicéntrico, lleva dos centrómeros, y el otro cromosoma es un fragmento acéntrico, sin centrómero, que se pierde. Y por tanto, los gametos van a llevar a alteraciones estructurales desequilibradas importantes. En el caso de una inversión pericéntrica como esta que tenemos representada aquí. La inversión incluye las regiones naranja y amarilla y además dentro de la inversión va el centrómero.
En este caso cuando se forma también durante la meiosis el bucle en el cromosoma que lleva a la inversión, se pueden alinear ambos homólogos y en este caso una recombinación a este nivel dentro del ASA dará lugar a dos cromosomas normales en cuanto que cada uno de ellos lleva un centrómero, pero vemos que llevan distintos tipos de elecciones o duplicaciones. Por ejemplo, uno de ellos lleva duplicada una región, en este caso la gris, y en cambio ha perdido las regiones que llevaban los marcadores azules. Y el otro cromosoma, los otros gametos, llevarán duplicación de estas regiones que llevaban el marcador azul y en cambio habrán... perdido de lesiones las regiones que llevaban los marcadores grises.
Por tanto, en los gametos resultantes habrá también distintos tipos de alteraciones estructurales desequilibradas.