🧬

Enzimoloji ve Proteinler Hakkında Bilgiler

Jul 17, 2024

Enzimoloji ve Proteinler Hakkında Bilgiler

Amino Asitler

  • Merkezi Karbon: Karbon, hidrojen, oksijen, ve en önemlisi azot atomu içerir.
  • Amino Asit Yapısı: Karboksil grubu (asidik), amino grubu (bazik), değişken R grubu.
  • Amfoterik Moleküller: Hem pozitif hem negatif yükler taşır.
  • R Grubu: Amino asiti benzersiz kılar ve özelliklerini belirler.
  • Değişken Grup: Karboksil grubu bulunduruyorsa asidik, amino grubu bulunduruyorsa bazik amino asittir.
  • Optik Aktiflik: Asimetrik karbon atomu içerir.
  • Amphoterik: Hem asidik hem bazik gruplar içerir.

Özel Amino Asitler

  • Eserin: Glikozi bağı oluşturur ve protein yapısında bulunur.
  • Alaninin: Yapısında asetik asit bulunur ve ketoasit oluşturur.
  • Valin, Lösin, İzöllüsin: Dallı zincirli amino asitler, kas metabolizmasında önemlidir.
  • Fenilalanin, Tirozin, Triptofan: Aromatik amino asitler; hormonlar ve neurotransmitterlerin öncülleridir.
  • Prolin: Yapısında asimetrik karbon atomu bulunmaz, hidrofilik, polar amino asittir.
  • Histidin: Tamponlama kapasitesi yüksek, imidazol halkası içerir, fizyolojik pH'da pozitif yük taşır.
  • Arjinin: Üre döngüsünde ve Nitrik Oksit üretiminde rol oynar.
  • Serin, Threonin, Tirozin: Fosforilasyona elverişli gruplar içerir.

Protein Yapıları

  • Primer Yapı: Peptit bağları belirler; amino asit dizilimi.
  • Sekonder Yapı: Alfa heliks ve beta tabaka; hidrojen bağlarıyla stabilize edilir.
  • Tersiyer Yapı: Proteinlerin üç boyutlu yapısı; zayıf etkileşimler ve kovalent bağlarla stabilize edilir.
  • Kuarterner Yapı: Birden fazla polipeptit zinciri içeren yapılar; proteini işlevsel hale getirir.

Enzimler ve Aktiveleri

  • Aktivasyon Enerjisi: Enzimler bu enerjiyi düşürerek reaksiyon hızını arttırır.
  • Enzim Aktivitesi: Konsantrasyon, pH, sıcaklık ve çeşitli düzenleyici moleküllerden etkilenir.
  • Allosterik Etki: Enzim üzerindeki belirli bölgelere bağlanarak fonksiyonlarını değiştirir.
  • Kooperatif Bağlanma: İlk substrat bağlandığında diğer substratların bağlanmasını kolaylaştırır.

Enzim Sınıfları

  • Oksidoredüktazlar: Redoks reaksiyonlarını katalize eder.
  • Transferazlar: Fonksiyonel grupları bir molekülden diğerine taşır.
  • Hidrolazlar: Su ile molekül yıkımını katalize eder.
  • Liyazlar: Çifte bağların yıkımını veya oluşumunu katalize eder.
  • İzomerazlar: Molekül içinde yeniden düzenlemeler yapar.
  • Ligazlar: ATP kullanarak iki molekülü birbirine bağlar.

Hastalıklar ve Diagnostik Enzimler

  • Fenilketonüri: Fenilalanin metabolizması bozukluğu; fenilalanin hidroksilaz eksikliği.
  • Alkaptonüri: Homogentisik asit oksidaz eksikliği; idrar bekletildiğinde siyahlaşır.
  • Homosisinüri: Sistein metabolizması bozukluğu; homosistein düzeyleri artar.
  • Akçaağaç Şurubu Hastalığı: Dallı zincirli amino asitlerin metabolizması bozukluğu.
  • Orak Hücre Anemisi: Hemoglobin yapısında değişiklik; valin yerine glutamik asit.
  • Laktik Dehidrogenaz (LDH): Kalp krizi veya hemolitik anemide artar.
  • Kreatin Kinaz (CK): Kas hasarının göstergesi.
  • Alkalen Fosfataz (ALP): Kemik ve karaciğer hastalıklarında artar.
  • Gamma-Glutamil Transferaz (GGT): Alkolik karaciğer hastalığı ve kolestazda artar.

Kanser Tümör Belirteçleri

  • PSA: Prostat kanseri
  • CEA: Kolorektal, mide, pankreas, meme kanseri
  • AFP: Karaciğer kanseri
  • CA-125: Over kanseri
  • CA-19-9: Pankreas kanseri

Genetik ve Metabolik Hastalıklar

  • Genetik Mutasyonlar: Enzim eksiklikleri, metabolik bozukluklar
  • Örnekler: Duchenne musküler distrofisi; distrofin geni mutasyonu.

Bilirubin Metabolizması

  • Bilirubin: Hem yıkımıyla oluşur.
  • Konjuge Bilirubin: Karaciğerde glukuronik asit ile konjuge edilir.

Kardiyak Belirteçler

  • Troponin: Myokard infarktüsünde en spesifik belirteç.
  • CK-MB: Kalp kası hasarında artar.
  • Miyoglobin: Akut myokard infarktüsünde erken dönemde artar.
  • Pro-BNP: Kalp yetmezliği tanısında kullanılır.

Glutatyon ve Gama-Glutamil Döngüsü

  • Glutatyon: Antioksidan aktivite, hücresel detoksifikasyon.
  • Gama-Glutamil Transferaz: Amino asitlerin hücreye taşınması

Sonuç ve Öneriler

  • Enzim ve protein yapısının anlaşılması: Hastalıkların tanı ve tedavisinde büyük öneme sahiptir.
  • Düzenli kontrol ve tarama: Erken tanı ve başarılı tedavi için önemlidir.