Síntese de Peptídeos e Estrutura de Proteínas

Fila do Carbono e Pontos Elétricos

• Fila do carbono: Importante para fazer análises de pontos elétricos de aminoácidos.
• Peptídeos: Nos peptídeos, a análise considera apenas os grupamentos R, já que amina e carboxila estão envolvidos na ligação peptídica.

Métodos de Síntese de Peptídeos

• Síntese in vitro: Utiliza enzimas ou componentes biológicos.
• Síntese completamente sintética: Usando uma matriz sólida; permite adição modular e controle preciso.

Detalhes sobre Síntese Completamente Sintética

• Processo envolve etapas de adição modular:
  • Exemplo: Ligação de glutamina após lavagem de amina anterior.

Síntese In Vitro a Partir de Sistemas Biológicos

• Requer um molde de RNA mensageiro, aminoácidos, tRNAs, etc.
• A ligação peptídica é catalisada pela estrutura ribossômica, majoritariamente composta por proteínas e RNA.

Reconhecimento entre tRNA e Aminoácidos

• Ligação específica: Reconhecimento do carbono alfa e amina para ligação.
• Função catalítica do ribossoma: Catalisada por RNA, não proteína.
• Ribossoma é uma mistura de proteínas e RNA ribossômico, onde a catálise ocorre especificamente entre certos grupos químicos.

Estrutura das Proteínas

• Estrutura Primária: Sequência linear de aminoácidos.
• Código de três letras: Convenção para nomear aminoácidos.
• Terminações:
  • N-terminal: Aminoácido com grupo amina livre.
  • C-terminal: Aminoácido com grupo carboxila livre.

Estrutura Secundária das Proteínas

• Alfa-hélice: Estrutura helicoidal mantida por ligações de hidrogênio.
• Folha pregueada: Estrutura plana e dobrada.
• Regiões não regulares: Sem conformação específica.

Manutenção das Estruturas Secundárias

• Pontes de hidrogênio: Mantém tanto a alfa-hélice quanto outras formas secundárias.
• Exemplo: Alfa-hélice de uma proteína específica (triptofano 206 ao 222).

Comparações com DNA

• Ligações de hidrogênio: Essenciais também na estrutura do DNA (dupla hélice).
• Dimensões e pareamentos diferentes: Apesar das semelhanças nas interações moleculares, as estruturais diferem entre DNA e proteínas.